В каждой пробке имеются отверстия для семян. Свежие семена овощей с высоким процентом всхожести можно сажать по одному в каждое отверстие. Семена зелени, за исключением базилика, – по несколько штук в каждую пробку. Крупные семена, возможно, придётся протолкнуть в глубину с помощью палочки или карандаша. После посева семян желательно накрыть их прозрачной пленкой создав таким образом эффект теплицы, но в этом нет особой необходимости. Очень важно обеспечить регулярный полив пробок: для прорастания семенам требуется влага.
Когда семена прорастут и превратятся в небольшие саженцы, наступает время их пересадки в более крупные кубики или блоки, особенно если это рассада помидоров, перца или огурцов. Огурцы готовы к пересадке уже через неделю (Рис. 8), помидоры через две, а перец через три недели. Для помидоров и перца используют кубики размером 7,5х7,5 см, для огурцов можно брать покрупнее.
Намного лучше брикеты искусственной почвы или специальные кассеты для выращивания рассады из пенополистирола (пенопласта) с отверстиями. В эти отверстия и вставляются пробки для сеянцев из минеральной ваты. Брикеты искусственной почвы выпускаются размером 2,5х2,5х3,8 см и соединены в пластины по 162 штуки. Они хороши тем, что сохраняют форму, имеют сбалансированный кислотно-щелочной баланс, хорошо обогащаются кислородом и способны длительно удерживать воду. Кроме того, такие брикеты просты в эксплуатации, легко отделяются от пластин. Брикеты отлично подходят для выращивания зелени, но для овощей они малы. Самые лучшим субстратом для выращивания рассады является минеральная вата (Рис.7).
В гидропонике посев семян производится в определённый субстрат, выбор которого большей частью зависит от типа системы и вида растений, которые будут в нём выращиваться. Многое зависит и от удобства наполнителя в эксплуатации, его структуры, способности удерживать влагу и насыщаться кислородом.